ماجرا از جایی شروع می‌شود که نویسنده‌ای مستقل دعوت می‌شود تا خانه‌ای را در حاشیه توکیو بررسی کند؛ خانه‌ای که در نگاه اول نورگیر، دلباز و بی‌نقص به نظر می‌رسد. اما وقتی او به نقشه‌ی طبقات دقیق‌تر نگاه می‌کند، متوجه فضاهایی می‌شود که در ظاهر هیچ کارکردی ندارند؛ دیوارهایی که میانشان اتاق‌هایی بدون پنجره یا راهروهایی بی‌انتها پنهان شده‌اند.

نویسنده برای بررسی بیشتر نقشه را به دوست معمارش نشان می‌دهد. همین تصمیم ساده، آغاز کشف جزئیاتی نگران‌کننده‌تر است: فضاهای مخفی در گوشه و کنار ساختمان که وجودشان منطقی به نظر نمی‌رسد. هم‌زمان، خبرهایی درباره‌ی ناپدید شدن ناگهانی ساکنان پیشین خانه، هاله‌ای از ترس و ابهام را بر ماجرا می‌افزاید.

با وسوسه‌ی حل کردن این معما، نویسنده و دوستش قدم به قدم در دل این خانه‌ی پررمزوراز پیش می‌روند. اما هرچه بیشتر پیش می‌روند، با حقیقتی مواجه می‌شوند که فراتر از معماری یا نقشه است؛ حقیقتی هولناک که نه‌تنها به ماهیت خانه مربوط می‌شود، بلکه به نیرویی مرموز گره خورده است. «خانه های عجیب» داستانی است درباره‌ی ترس، وسوسه و ناتوانی انسان در برابر ناشناخته‌ها.