کتاب در جستجوی ذوالقرنین، تلاشی است برای شناسایی شخصیت ذوالقرنین که قرآن در سوره کهف در چندین آیه ماجرای او را نقل کرده است. در بین ایرانیان به ویژه پس از انتشار نظر علامه طباطبایی بسیاری شخصیت ذوالقرنین را بر کوروش کبیر تطبیق می‌کنند که نخستین بار از سوی ابوالکلام آزاد و یا  احمدخان هندی مطرح شده است. با این حال نویسنده این کتاب با مطالعه زندگی کوروش و گزارش آن نشان می‌دهد که کوروش نمی‌تواند ذوالقرنین باشد. در بخشی از کتاب نیز تطبیق او با اسکندر مقدونی را نقد می‌کند و بالاخره به این نتیجه می‌رسد که تنها شخصیت قابل تطبیق بر ذوالقرنین گیلگمش پادشاه افسانه‌ای سومری است. 

نویسنده از روایات شیعی فراوانی استفاده کرده است و تطبیق اسکندر و ذوالقرنین را نتیجه روایات اهل سنت و روایات اسرائیلیات وارد شده از علمای یهود می‌داند. 

به نظرم کتاب زیاده‌نویسی کم‌ نداشت و می‌شد که کتاب خلاصه‌تر باشد. قلم نویسنده خسته‌کننده نیست و اطلاعات زیادی هم از کتاب به دست خواننده می‌آید.