از آن جا که بعد معنویت قرآن یکی از ابعاد اعجاز این کتاب الهی است و با مسأله طهارت روح و تزکیه نفس انسان ارتباط دارد در این کتاب به بررسی این بعد از قرآن پرداخته شده است. مطالب کتاب در یک مقدمه و چهار فصل تنظیم شده است: در فصل اول، درباره ی خواص روح و حقیقت نفس و ادله ثبات روح و تجرد نفس با ادله عقلی و نقلی گفتگو شده است؛ در فصل دوم، فطریات انسان و اهمیت موضوع فطرت از لحاظ روانشناسی و قرآن بررسی گردیده است؛ در فصل سوم، موضوع اصلی بحث یعنی بحران معنویت از لحاظ اخلاق و اعتقادات و پیامدهای بحران و علت فاصله گرفتن جامعه از دین و آثار شوم آن به تفضیل تجزیه و تحلیل گردیده است و در فصل چهارم راهکارهای هدایتی قرآن در این خصوص و همچنین راهنمایی هایی از سخنان علی علیه السلام در نهج البلاغه ارائه گردیده است.