سایه مردی سیاهپوش به دنبال ایمی کاهیل 14 ساله و برادر کوچکش؛ دن، است که جهان را برای پیدا کردن سی و نه سرنخ که به قدرتی خارق العاده منجر می شود؛ جستجو می کنند. ایمی و دن می دانند که مرد سیاهپوش می کوشد تا آنها را بکشد. می دانند که او یک مادریگال است، عضو خلاق ترین و وحشتناک ترین گروه شکار سرنخ. و چیز دیگری را هم می دانند، رازی که ترجیح می دادند فراموشش کنند؛ اینکه پدر و مادرشان هم مادریگالی بودند. ایمی و دن باید تند وچابک بدوند، ولی نمی توانند از دست مردی که تعقیب شان می کند؛ فرار کنند. و حالا در پی یک تراژدی، مرد آماده می شود تا برای نبرد نهایی از تاریکی به بیرون قدم بگذارد.