مباحث کتاب((خلافت کبری)) در باب امام و خلیفه پس از پیامبر(ص) است که با استناد به آیات قرآن و روایات تدوین شده است .مولف ابتدا مراتب یقین، شناخت  و مراحل یقین را از دیدگاه((محمدرضا قمشه ای)) بیان می دارد، سپس این موضوعات  را مطرح می سازد :قضای تفصیلی الهی ;قضای علمی ;نفوس فلکی ;قدر و اختیار ; مراتب علم خدا ;توضیح مقام رسالت و خلافت ;اهداف بعثت ;فلسفه نیاز به نیایش ; ویژگی های جانشین ;صلح حدیبیه ;تخلف از لشکر اسامه ;احادیث خلافت و ولایت ; ولایت از دیدگاه ابن عربی ;نوشته های اهل سنت درباره حضرت مهدی(ع) ;مراتب  ولایت و نظایر آن .