شرلوک هلمز سرزمین موش ها بازیل یک موش نابغه است که چون در زیرزمین خانه ی شرلوک هلمز زندگی میکند،فوت وفن های زیادی از این کارآگاه بزرگ یاد گرفته.وقتی بچه دزدها آنجلا و آگاتای دوقلو را می دزدند، بازیل برای پیدا کردن آنها فقط چند تا سرنخ پیش پا افتاده دارد. اما در همین زمان، پیغامی از بچه دزدها میرسد و معلوم میشود که پای یک گروه جنایتکار حرفه ای به اسم سه تبهکار ترسناک در میان است. بازیل میداند حتی یک لحظه هم نباید وقت را هدر بدهد و به هر قیمتی که شده، باید دوقلوها را پیدا کند... .