مجموعه دو جلدی "تعلیقات علی الحکمه المتعالیه "در یک مجلد به زبان عربی به طبع رسیده است .این کتاب حاوی تقریرات و درس های "شهید سید مصطفی خمینی " است که در زمان تبعید به نجف اشرف برای طلاب حوزه های علمیه فراهم کرده اند . کتاب در اصل تعلیقات و توضیحات نگارنده بر کتاب اسفار اربعه صدرالمتالهین  شیرازی (ملاصدرا) است .عمده مباحث کتاب حول مقوله "جواهر و اعراض "تالیف  شده است .نگارنده، نخست نظرات ملاصدرا را با اشاره به منابع و ماخذ آن  ذکر می کند، سپس دیدگاه های خود را در این باب شرح می دهد .