마침내 다시 열린 카르테논 신전! 이중 던전에 성진우를 초대한 존재는, 자신을 '시스템의 설계자'라고 칭하며 마지막 시험을 치를 것을 강요한다. 한편, 일본 도쿄 상공에 생긴 S급 게이트에서는 거인들이 쏟아져 나와, 이를 막기 위해 S급 헌터들이 동원되는데….