داستان خیالی حاضر ماجرای دوستی بچه کوتوله ای است به نام((نیلز)) با پسرکی به نام((برتیل)) .برتیل که بیشتر اوقات در خانه تنها است، روزی در زیر تختش  متوجه سر و صدایی می شود .او در آن جا کوتوله ای را می بیند که خانه موشی در زیر  اتاق برتیل اجاره کرده است .برتیل با کوتوله که خود را((نیلز)) معافی می کند  دوست می شود و عاقبت نیلز روش کوتوله شدن را به نیلز می آموزد .برتیل با کوتوله  شدن، سپس بزرگ شدن به نیلز کمک می کند تا خانه کوچک زیر زمینیش را روبه راه کند . بدین ترتیب، دوستی میان این دو سبب می شود آنان اوقات خوشی را سپری کنند .