مهاجرت نخبگان از سرزمین اسلامی، پدیده ای است که ریشه های اجتماعی، اقتصادی، سیاسی و علمی دارد که تا فراتر از حوزه آیسسکو، گسترش می یابند. بااین وجود، این سازمان مصمم شده تا از طریق ایجاد برنامه های قوی در سایه راهبردهای بهره مندی از توانمندی نخبگان مسلمان در غرب و در چارچوب توانمندی های فرهنگی، علمی و آموزشی خود، این پدیده را موردبررسی قرار دهد. این برنامه ها آیسسکو را برای شفافیت بیشتر پدیده رو به رشد مهاجرت نخبگان و انجام مطالعات بیشتر بر روی شرایط و نیازهای آن ها ترغیب می نماید. بنابراین هدف این سازمان، ارائه راهکارهایی برای استفاده از این توانمندی های ارتقاء گفتگوی فرهنگی میان مسلمانان و ایجاد تبادل فرهنگی میان کشورهای مسلمان جهت بهره بردن از نخبگان مهاجر است. در راستای پاسخ به این نیازها و چالش های آیسسکو راهبردهای بهره مندی از توانمندی نخبگان مسلمان در غرب را با توجه به پیشرفت های اخیر در جهان اسلام و الزامات توسعه جامع و پایدار تدوین کرد.