با تشکیل دولت صفوی در ایران نه تنها پس از قرن­ها یکپارچگی سیاسی این سرزمین شکل گرفت. بلکه از نظر مذهبی نیز ایران دارای هویت متمایزی گردید. شاه اسماعیل ضمن رسمیت بخشیدن به تشیع در ایران، به دعوت از علمای لبنان، سوریه و عراق مبادرت کرد و با ادامه این سیاست در زمان جانشینان وی فصل تازه­ای در تاریخ ایران آغاز شد که با حضور گسترده علمای شیعه و ارائه دیدگاه­های فقهی جدید و کسب مناصب و مقامات مذهبی در دولت مشخص می­گردد. کتاب تغییر مذهب در ایران به بررسی این روند از آغاز دولت صفوی و فراز و نشیب­های آن پرداخته است.