در این کتاب بیشتر روش های جدید و بروز اکولوژی میکروبی مولکولی با کاربرد اختصاصی نشخوارکنندگان ارائه شده است. در ابتدا طرح آزمایشات دامی برای مطالعات اکولوژی میکروبی بیان و سپس روش های کلاسیک آزمایشگاهی مبتنی بر کشت برای مطالعه میکروب های شکمبه شرح داده شده است. در ادامه تکنیک ها و دستورالعمل های آزمایشگاهی اکولوژی میکروبی معرفی و در پایان تکنیک های توانایی مطالعه میکروبیوم کامل توضیح داده شده است.